A highly virulent variant of HIV-1 circulating in the Netherlands (2024)

https://doi.org/10.1126/science.abk1688 ·

Видання: Science, 2022, №6580, с.540-545

Видавець: American Association for the Advancement of Science (AAAS)

Автори:

Chris Wymant
Daniela Bezemer
François Blanquart
Luca Ferretti
Astrid Gall
Matthew Hall
Tanya Golubchik
Margreet Bakker
Swee Hoe Ong
Lele Zhao
David Bonsall
Mariateresa de Cesare
George MacIntyre-co*ckett
Lucie Abeler-Dörner
Jan Albert
Norbert Bannert
Jacques Fellay
M. Kate Grabowski
Barbara Gunsenheimer-Bartmeyer
Huldrych F. Günthard
Pia Kivelä
Roger D. Kouyos
Oliver Laeyendecker
Laurence Meyer
Kholoud Porter
Matti Ristola
Ard van Sighem
Ben Berkhout
Paul Kellam
Marion Cornelissen
Peter Reiss
Christophe Fraser
V. Aubert
M. Battegay
E. Bernasconi
J. Böni
D. L. Braun
H. C. Bucher
C. Burton-Jeangros
A. Calmy
M. Cavassini
G. Dollenmaier
M. Egger
L. Elzi
J. Fehr
J. Fellay
H. Furrer
C. A. f*ck
M. Gorgievski
H. Günthard
D. Haerry
B. Hasse
H. H. Hirsch
M. Hoffmann
I. Hösli
C. Kahlert
L. Kaiser
O. Keiser
T. Klimkait
R. Kouyos
H. Kovari
B. Ledergerber
G. Martinetti
B. Martinez de Tejada
C. Marzolini
K. Metzner
N. Müller
D. Nadal
D. Nicca
G. Pantaleo
A. Rauch
S. Regenass
C. Rudin
F. Schöni-Affolter
P. Schmid
R. Speck
M. Stöckle
P. Tarr
A. Trkola
P. Vernazza
R. Weber
S. Yerly
M. van der Valk
S. E. Geerlings
A. Goorhuis
J. W. Hovius
B. Lempkes
F. J. B. Nellen
T. van der Poll
J. M. Prins
P. Reiss
M. van Vugt
W. J. Wiersinga
F. W. M. N. Wit
M. van Duinen
J. van Eden
A. Hazenberg
A. M. H. van Hes
F. J. J. Pijnappel
S. Y. Smalhout
A. M. Weijsenfeld
S. Jurriaans
N. K. T. Back
H. L. Zaaijer
B. Berkhout
M. T. E. Cornelissen
C. J. Schinkel
K. C. Wolthers
E. J. G. Peters
M. A. van Agtmael
R. S. Autar
M. Bomers
K. C. E. Sigaloff
M. Heitmuller
L. M. Laan
C. W. Ang
R. van Houdt
M. Jonges
T. W. Kuijpers
D. Pajkrt
H. J. Scherpbier
C. de Boer
A. van der Plas
M. van den Berge
A. Stegeman
S. Baas
L. Hage de Looff
A. Buiting
A. Reuwer
J. Veenemans
B. Wintermans
M. J. H. Pronk
H. S. M. Ammerlaan
D. N. J. van den Bersselaar
E. S. de Munnik
B. Deiman
A. R. Jansz
V. Scharnhorst
J. Tjhie
M. C. A. Wegdam
A. van Eeden
J. Nellen
W. Brokking
L. J. M. Elsenburg
H. Nobel
M. E. E. van Kasteren
M. A. H. Berrevoets
A. E. Brouwer
A. Adams
R. van Erve
B. A. F. M. de Kruijf-van de Wiel
S. Keelan-Phaf
B. van de Ven
B. van der Ven
A. G. M. Buiting
J. L. Murck
T. E. M. S. de Vries-Sluijs
H. I. Bax
E. C. M. van Gorp
N. C. de Jong-Peltenburg
M. de Mendonç̧a Melo
E. van Nood
J. L. Nouwen
B. J. A. Rijnders
C. Rokx
C. A. M. Schurink
L. Slobbe
A. Verbon
N. Bassant
J. E. A. van Beek
M. Vriesde
L. M. van Zonneveld
J. de Groot
C. A. B. Boucher
M. P. G. Koopmans
J. J. A. van Kampen
P. L. A. Fraaij
A. M. C. van Rossum
C. L. Vermont
L. C. van der Knaap
E. Visser
J. Branger
R. A. Douma
A. S. Cents-Bosma
C. J. H. M. Duijf-van de Ven
E. F. Schippers
C. van Nieuwkoop
J. M. van Ijperen
J. Geilings
G. van der Hut
N. D. van Burgel
E. M. S. Leyten
L. B. S. Gelinck
F. Mollema
S. Davids-Veldhuis
C. Tearno
G. S. Wildenbeest
E. Heikens
P. H. P. Groeneveld
J. W. Bouwhuis
A. J. J. Lammers
S. Kraan
A. G. W. van Hulzen
M. S. M. Kruiper
G. L. van der Bliek
P. C. J. Bor
S. B. Debast
G. H. J. Wagenvoort
F. P. Kroon
M. G. J. de Boer
H. Jolink
M. M. C. Lambregts
A. H. E. Roukens
H. Scheper
W. Dorama
N. van Holten
E. C. J. Claas
E. Wessels
J. G. den Hollander
R. El Moussaoui
K. Pogany
C. J. Brouwer
J. V. Smit
D. Struik-Kalkman
T. van Niekerk
O. Pontesilli
S. H. Lowe
A. M. L. Oude Lashof
D. Posthouwer
M. E. van Wolfswinkel
R. P. Ackens
K. Burgers
J. Schippers
B. Weijenberg-Maes
I. H. M. van Loo
T. R. A. Havenith
M. G. A. van Vonderen
L. M. Kampschreur
S. Faber
R. Steeman-Bouma
A. Al Moujahid
G. J. Kootstra
C. E. Delsing
M. van der Burg-van de Plas
L. Scheiberlich
W. Kortmann
G. van Twillert
R. Renckens
D. Ruiter-Pronk
F. A. van Truijen-Oud
J. W. T. Cohen Stuart
ER. Jansen
M. Hoogewerf
W. Rozemeijer
W. A. van der Reijden
J. C. Sinnige
K. Brinkman
G. E. L. van den Berk
W. L. Blok
K. D. Lettinga
M. de Regt
W. E. M. Schouten
J. E. Stalenhoef
J. Veenstra
S. M. E. Vrouenraets
H. Blaauw
G. F. Geerders
M. J. Kleene
M. Kok
M. Knapen
I. B. van der Meché
E. Mulder-Seeleman
A. J. M. Toonen
S. Wijnands
E. Wttewaal
D. Kwa
R. van Crevel
K. van Aerde
A. S. M. Dofferhoff
S. S. V. Henriet
H. J. M. ter Hofstede
J. Hoogerwerf
M. Keuter
O. Richel
M. Albers
K. J. T. Grintjes-Huisman
M. de Haan
M. Marneef
R. Strik-Albers
J. Rahamat-Langendoen
F. F. Stelma
D. Burger
E. H. Gisolf
R. J. Hassing
M. Claassen
G. ter Beest
P. H. M. van Bentum
N. Langebeek
R. Tiemessen
C. M. A. Swanink
S. F. L. van Lelyveld
R. Soetekouw
L. M. M. van der Prijt
J. van der Swaluw
N. Bermon
W. A. van der Reijden
R. Jansen
B. L. Herpers
D. Veenendaal
D. W. M. Verhagen
F. N. Lauw
M. C. van Broekhuizen
M. van Wijk
W. F. W. Bierman
M. Bakker
J. Kleinnijenhuis
E. Kloeze
A. Middel
D. F. Postma
E. H. Schölvinck
Y. Stienstra
A. R. Verhage
M. Wouthuyzen-Bakker
A. Boonstra
H. de Groot-de Jonge
P. A. van der Meulen
D. A. de Weerd
H. G. M. Niesters
C. C. van Leer-Buter
M. Knoester
A. I. M. Hoepelman
J. E. Arends
R. E. Barth
A. H. W. Bruns
P. M. Ellerbroek
T. Mudrikova
J. J. Oosterheert
E. M. Schadd
B. J. van Welzen
K. Aarsman
B. M. G. Griffioen-van Santen
I. de Kroon
M. van Berkel
C. S. A. M. van Rooijen
R. Schuurman
F. Verduyn-Lunel
A. M. J. Wensing
L. J. Bont
S. P. M. Geelen
Y. G. T. Loeffen
T. F. W. Wolfs
N. Nauta
E. O. W. Rooijakkers
H. Holtsema
R. Voigt
D. van de Wetering
A. Alberto
I. van der Meer
A. Rosingh
T. Halaby
S. Zaheri
A. C. Boyd
D. O. Bezemer
A. I. van Sighem
C. Smit
M. Hillebregt
A. de Jong
T. Woudstra
D. Bergsma
R. Meijering
L. van de Sande
T. Rutkens
S. van der Vliet
L. de Groot
M. van den Akker
Y. Bakker
A. El Berkaoui
M. Bezemer
N. Brétin
E. Djoechro
M. Groters
E. Kruijne
K. J. Lelivelt
C. Lodewijk
E. Lucas
L. Munjishvili
F. Paling
B. Peeck
C. Ree
R. Regtop
Y. Ruijs
M. Schoorl
P. Schnörr
A. Scheigrond
E. Tuijn
L. Veenenberg
K. M. Visser
E. C. Witte
Y. Ruijs
Maartje Van Frankenhuijsen
Thierry Allegre
Djamila Makhloufi
Jean-Michel Livrozet
Pierre Chiarello
Mathieu Godinot
Florence Brunel-Dalmas
Sylvie Gibert
Christian Trepo
Dominique Peyramond
Patrick Miailhes
Joseph Koffi
Valérie Thoirain
Corinne Brochier
Thomas Baudry
Sylvie Pailhes
Alain Lafeuillade
Gisèle Philip
Gilles Hittinger
Assi Assi
Véronique Lambry
Eric Rosenthal
Alissa Naqvi
Brigitte Dunais
Eric Cua
Christian Pradier
Jacques Durant
Aline Joulie
Denis Quinsat
Serge Tempesta
Isabelle Ravaux
Isabelle Poizot Martin
Olivia Faucher
Nicolas Cloarec
Hélène Champagne
Gilles Pichancourt
Philippe Morlat
Thierry Pistone
Fabrice Bonnet
Patrick Mercie
Isabelle Faure
Mojgan Hessamfar
Denis Malvy
Denis Lacoste
Marie-Carmen Pertusa
Marie-Anne Vandenhende
Noëlle Bernard
François Paccalin
Cédric Martell
Julien Roger-Schmelz
Marie-Catherine Receveur
Pierre Duffau
Denis Dondia
Emmanuel Ribeiro
Sabrina Caltado
Didier Neau
Michel Dupont
Hervé Dutronc
Frédéric Dauchy
Charles Cazanave
Marc-Olivier Vareil
Gaétane Wirth
Séverine Le Puil
Jean-Luc Pellegrin
Isabelle Raymond
Jean-François Viallard
Severin Chaigne de Lalande
Daniel Garipuy
Pierre Delobel
Martine Obadia
Lise Cuzin
Muriel Alvarez
Noemie Biezunski
Lydie Porte
Patrice Massip
Alexa Debard
Florence Balsarin
Myriam Lagarrigue
François Prevoteau du Clary
Christian Aquilina
Jacques Reynes
Vincent Baillat
Corinne Merle
Vincent Lemoing
Nadine Atoui
Alain Makinson
Jean Marc Jacquet
Christina Psomas
Christine Tramoni
Hugues Aumaitre
Mathieu Saada
Marie Medus
Martine Malet
Aurélia Eden
Ségolène Neuville
Milagros Ferreyra
Albert Sotto
Claudine Barbuat
Isabelle Rouanet
Didier Leureillard
Jean-Marc Mauboussin
Catherine Lechiche
Régine Donsesco
André Cabie
Sylvie Abel
Sandrine Pierre-Francois
Anne-Sophie Batala
Christophe Cerland
Camille Rangom
Nadine Theresine
Bruno Hoen
Isabelle Lamaury
Isabelle Fabre
Kinda Schepers
Elodie Curlier
Rachida Ouissa
Catherine Gaud
Carole Ricaud
Roland Rodet
Guillaume Wartel
Carmele Sautron
Geneviève Beck-Wirth
Catherine Michel
Charles Beck
Jean-Michel Halna
Jakub Kowalczyk
Meryem Benomar
Christine Drobacheff-Thiebaut
Catherine Chirouze
Jean-François Faucher
François Parcelier
Adeline Foltzer
Cécile Haffner-Mauvais
Mathieu Hustache Mathieu
Aurélie Proust
Lionel Piroth
Pascal Chavanet
Michel Duong
Marielle Buisson
Anne Waldner
Sophie Mahy
Sandrine Gohier
Delphine Croisier
Thierry May
Mikael Delestan
Marie Andre
Mahsa Mohseni Zadeh
Martin Martinot
Béatrice Rosolen
Anne Pachart
Benoît Martha
Noëlle Jeunet
David Rey
Christine Cheneau
Maria Partisani
Michèle Priester
Claudine Bernard-Henry
Marie-Laure Batard
Patricia Fischer
Jean-Luc Berger
Isabelle Kmiec
Olivier Robineau
Thomas Huleux
Faïza Ajana
Isabelle Alcaraz
Christophe Allienne
Véronique Baclet
Agnès Meybeck
Michel Valette
Nathalie Viget
Emmanuelle Aissi
Raphael Biekre
Pauline Cornavin
Dominique Merrien
Jean-Christophe Seghezzi
Moise Machado
Georges Diab
François Raffi
Bénédicte Bonnet
Clotilde Allavena
Olivier Grossi
Véronique Reliquet
Eric Billaud
Cecile Brunet
Sabelline Bouchez
Pascale Morineau-Le Houssine
Fabienne Sauser
David Boutoille
Michel Besnier
Hervé Hue
Nolwenn Hall
Delphine Brosseau
Faouzi Souala
Christian Michelet
Pierre Tattevin
Cédric Arvieux
Matthieu Revest
Helene Leroy
Jean-Marc Chapplain
Matthieu Dupont
Fabien Fily
Solène Patra-Delo
Céline Lefeuvre
Louis Bernard
Frédéric Bastides
Pascale Nau
Renaud Verdon
Arnaud de la Blanchardiere
Anne Martin
Philippe Feret
Loïk Geffray
Corinne Daniel
Jennifer Rohan
Pascale Fialaire
Jean Marie Chennebault
Valérie Rabier
Pierre Abgueguen
Sami Rehaiem
Odile Luycx
Mathilde Niault
Philippe Moreau
Yves Poinsignon
Marie Goussef
Virginie Mouton-Rioux
Dominique Houlbert
Sandrine Alvarez-Huve
Frédérique Barbe
Sophie Haret
Philippe Perre
Sophie Leantez-Nainville
Jean-Luc Esnault
Thomas Guimard
Isabelle Suaud
Jean-Jacques Girard
Véronique Simonet
Yasmine Debab
Jean-Luc Schmit
Christine Jacomet
Pierre Weinberck
Claire Genet
Pauline Pinet
Sophie Ducroix
Hélène Durox
Éric Denes
Bruno Abraham
Florence Gourdon
Odile Antoniotti
Jean-Michel Molina
Samuel Ferret
Caroline Lascoux-Combe
Matthieu Lafaurie
Nathalie Colin de Verdiere
Diane Ponscarme
Nathalie De Castro
Alexandre Aslan
Willy Rozenbaum
Claire Pintado
François Clavel
Olivier Taulera
Caroline Gatey
Anne-Lise Munier
Sandrine Gazaigne
Pauline Penot
Guillaume Conort
Nathalie Lerolle
Anne Leplatois
Stéphanie Balausine
Jeannine Delgado
Julie Timsit
Magda Tabet
Laurence Gerard
Pierre-Marie Girard
Odile Picard
Jürgen Tredup
Diane Bollens
Nadia Valin
Pauline Campa
Julie Bottero
Benedicte Lefebvre
Muriel Tourneur
Laurent Fonquernie
Charlotte Wemmert
Jean-Luc Lagneau
Yazdan Yazdanpanah
Bao Phung
Adriana Pinto
Dorothée Vallois
Ornella Cabras
Françoise Louni
Gilles Pialoux
Thomas Lyavanc
Valérie Berrebi
Julie Chas
Sophie Lenagat
Agathe Rami
Myriam Diemer
Maguy Parrinello
Audrey Depond
Dominique Salmon
Loïc Guillevin
Tassadit Tahi
Linda Belarbi
Pierre Loulergue
Olivier Zak Dit Zbar
Odile Launay
Benjamin Silbermann
Catherine Leport
Laura Alagna
Marie-Pierre Pietri
Anne Simon
Manuela Bonmarchand
Naouel Amirat
François Pichon
Myriam Kirstetter
Christine Katlama
Marc Antoine Valantin
Roland Tubiana
Fabienne Caby
Luminita Schneider
Nadine Ktorza
Ruxandra Calin
Audrey Merlet
Saadia Ben Abdallah
Laurence Weiss
Martin Buisson
Dominique Batisse
Marina Karmochine
Juliette Pavie
Catherine Minozzi
Didier Jayle
Philippe Castel
Jean Derouineau
Pascale Kousignan
Murielle Eliazevitch
Isabelle Pierre
Lio Collias
Jean-Paul Viard
Jacques Gilquin
Alain Sobel
Laurence Slama
Jade Ghosn
Blanka Hadacek
Nugyen Thu-Huyn
Lella Nait-Ighil
Agnes Cros
Aline Maignan
Claudine Duvivier
Paul Henri Consigny
Fanny Lanternier
Michka Shoai-Tehrani
Fatima Touam
Saadia Jerbi
Loïc Bodard
Corinne Jung
Cécile Goujard
Yann Quertainmont
Martin Duracinsky
Olivier Segeral
Arnaud Blanc
Delphine Peretti
Antoine Cheret
Christelle Chantalat
Marie Josée Dulucq
Yves Levy
Jean Daniel Lelievre
Anne Sophie Lascaux
Cécile Dumont
François Boue
Véronique Chambrin
Sophie Abgrall
Imad Kansau
Mariem Raho-Moussa
Pierre De Truchis
Aurélien Dinh
Benjamin Davido
Dhiba Marigot
Huguette Berthe
Alain Devidas
Pierre Chevojon
Amélie Chabrol
Nouara Agher
Yvon Lemercier
Fabrice Chaix
Isabelle Turpault
Olivier Bouchaud
Patricia Honore
Elisabeth Rouveix
Evelyne Reimann
Alix Greder Belan
Claire Godin Collet
Safia Souak
Emmanuel Mortier
Martine Bloch
Anne-Marie Simonpoli
Véronique Manceron
Isabelle Cahitte
Emmanuel Hiraux
Erik Lafon
François Cordonnier
Ai-feng Zeng
David Zucman
Catherine Majerholc
Dominique Bornarel
Agnès Uludag
Justine Gellen-Dautremer
Agnès Lefort
Christine Bazin
Vincent Daneluzzi
Juliette Gerbe
Vincent Jeantils
Mélissa Coupard
Olivier Patey
Jonas Bantsimba
Sophie Delllion
Pauline Caraux Paz
Benoit Cazenave
Laurent Richier
Valérie Garrait
Isabelle Delacroix
Brigitte Elharrar
Daniel Vittecoq
Claudine Bolliot
Annie Lepretre
Philippe Genet
Virginie Masse
Véronique Perrone
Jean-Luc Boussard
Patricia Chardon
Eric Froguel
Philippe Simon
Sylvie Tassi
Véronique Avettand Fenoel
Francis Barin
Christine Bourgeois
Fanny Cardon
Marie-Laure Chaix
Jean François Delfraissy
Asma Essat
Hugues Fischer
Camille Lecuroux
Laurence Meyer
Ventzislava Petrov-Sanchez
Christine Rouzioux
Asier Saez-Cirion
Rémonie Seng
Kristin Kuldanek
Scott Mullaney
Carmel Young
Antonella Zucchetti
Margaret-Ann Bevan
Sinead McKernan
Emily Wandolo
Celia Richardson
Elaney Youssef
Pippa Green
Sue Faulkner
Rebecca Faville
Sandra Herman
Christine Care
Helen Blackman
Katharine Bellenger
Keith Fairbrother
Andrew Phillips
Abdel Babiker
Valerie Delpech
Sarah Fidler
Mindy Clarke
Julie Fox
Richard Gilson
David Goldberg
David Hawkins
Anne Johnson
Margaret Johnson
Ken McLean
Eleni Nastouli
Frank Post
N. Kennedy
J. Pritchard
U. Andrady
N. Rajda
C. Donnelly
S. McKernan
S. Drake
G. Gilleran
D. White
J. Ross
J. Harding
R. Faville
J. Sweeney
P. Flegg
S. Toomer
H. Wilding
R. Woodward
G. Dean
C. Richardson
N. Perry
M. Gompels
L. Jennings
D. Bansaal
M. Browing
L. Connolly
B. Stanley
S. Estreich
A. Magdy
C. O’Mahony
P. Fraser
S. P. R Jebakumar
L. David
R. Mette
H. Summerfield
M. Evans
C. White
R. Robertson
C. Lean
S. Morris
A. Winter
S. Faulkner
B. Goorney
L. Howard
I. Fairley
C. Stemp
L. Short
M. Gomez
F. Young
M. Roberts
S. Green
K. Sivakumar
J. Minton
A. Siminoni
J. Calderwood
D. Greenhough
C. DeSouza
Lisa Muthern
C. Orkin
S. Murphy
M. Truvedi
K. McLean
D. Hawkins
C. Higgs
A. Moyes
S. Antonucci
S. McCormack
W. Lynn
M. Bevan
J. Fox
A. Teague
J. Anderson
S. Mguni
F. Post
L. Campbell
C. Mazhude
H. Russell
R. Gilson
G. Carrick
J. Ainsworth
A. Waters
P. Byrne
M. Johnson
S. Fidler
K. Kuldanek
S. Mullaney
V. Lawlor
R. Melville
A. Sukthankar
S. Thorpe
C. Murphy
E. Wilkins
S. Ahmad
P. Green
S. Tayal
E. Ong
J. Meaden
L. Riddell
D. Loay
K. Peaco*ck
H. Blackman
V. Harindra
A. M. Saeed
S. Allen
U. Natarajan
O. Williams
H. Lacey
C. Care
C. Bowman
S. Herman
S. V. Devendra
J. Wither
A. Bridgwood
G. Singh
S. Bushby
D. Kellock
S. Young
G. Rooney
B. Snart
J. Currie
M. Fitzgerald
J. Arumainayyagam
S. Chandramani
S. Rajamanoharan
T. Robinson
B. Taylor
C. Brewer
Christoph Mayr
Wolfgang Schmidt
Andrea Speidel
Frank Strohbach
Keikawus Arastéh
Christiane Cordes
Manfred Stündel
Jörg Claus
Axel Baumgarten
Andreas Carganico
Patrick Ingiliz
Stephan Dupke
Matthias Freiwald
Michael Rausch
Arend Moll
Dorothea Schleehauf
Bettina Hintsche
Gerd Klausen
Heiko Jessen
Arne Jessen
Siegfried Köppe
Peter Kreckel
Dietmar Schranz
Klaus Fischer
Hubert Schulbin
Miriam Speer
Tobias Glaunsinger
Thomas Wicke
Bernhard Bieniek
Heribert Hillenbrand
Frank Schlote
Elke Lauenroth-Mai
Christoph Schuler
Dirk Schürmann
Hans Wesselmann
Norbert Brockmeyer
Peter Gehring
Dirk Schmalöer
Martin Hower
Petra Sp*rnraft-Ragaller
Dieter Häussinger
Stefan Reuter
Stefan Esser
Rudolf Markus
Burkhard Kreft
Dirk Berzow
Andreas Christl
Andreas Meyer
Andreas Plettenberg
Albrecht Stoehr
Katrin Graefe
Thore Lorenzen
Axel Adam
Knut Schewe
Lutwin Weitner
Stefan Fenske
Stefan Hansen
Hans-Jürgen Stellbrink
Dorothea Wiemer
Sandra Hertling
Reinhold Schmidt
Peter Arbter
Bernd Claus
Peter Galle
Hans Jäger
Eva Jä̈gel-Guedes
Nils Postel
Monika Fröschl
Christoph Spinner
Johannes Bogner
Bernd Salzberger
Jürgen Schölmerich
Franz Audebert
Ties Marquardt
Andreas Schaffert
Eiko Schnaitmann
Andreas Trein
Bernhard Frietsch
Marcus Müller
Albrecht Ulmer
Barbara Detering-Hübner
Peter Kern
Franz Schubert
Günther Dehn
Maria Schreiber
Cengiz Güler
Barbara Gunsenheimer-Bartmeyer
Daniel Schmidt
Karolin Meixenberger
Norbert Bannert
the Netherlands ATHENA HIV Observational Cohort†
the BEEHIVE Collaboration†

Анотація

We discovered a highly virulent variant of subtype-B HIV-1 in the Netherlands. One hundred nine individuals with this variant had a 0.54 to 0.74 log <jats:sub>10</jats:sub> increase (i.e., a ~3.5-fold to 5.5-fold increase) in viral load compared with, and exhibited CD4 cell decline twice as fast as, 6604 individuals with other subtype-B strains. Without treatment, advanced HIV—CD4 cell counts below 350 cells per cubic millimeter, with long-term clinical consequences—is expected to be reached, on average, 9 months after diagnosis for individuals in their thirties with this variant. Age, sex, suspected mode of transmission, and place of birth for the aforementioned 109 individuals were typical for HIV-positive people in the Netherlands, which suggests that the increased virulence is attributable to the viral strain. Genetic sequence analysis suggests that this variant arose in the 1990s from de novo mutation, not recombination, with increased transmissibility and an unfamiliar molecular mechanism of virulence.

Список літератури

L. Råberg M. Stjernman in Ecoimmunology G. Demas R. Nelson Eds. (Oxford Univ. Press 2011) pp. 548–578.
Marc Lipsitch (@mlipsitch) Twitter 15 February 2020 https://twitter.com/mlipsitch/status/1228734360716791815.
C. Wymant C. Fraser F. Blanquart Analysis code for “A highly virulent variant of HIV-1 circulating in the Netherlands” Zenodo version 1 (2021); https://doi.org/10.5281/zenodo.5761935.
A. M. Wensing, V. Calvez, H. F. Günthard, V. A. Johnson, R. Paredes, D. Pillay, R. W. Shafer, D. D. Richman, 2015 Update of the Drug Resistance Mutations in HIV-1. Top. Antivir. Med. 23, 132–141 (2015). 26713503
B. Korber in Computational and Evolutionary Analysis of HIV Molecular Sequences A. G. Rodrigo G. H. Learn Eds. (Kluwer Academic Publishers 2000) pp. 55–72.
M. Nei, T. Gojobori, Simple methods for estimating the numbers of synonymous and nonsynonymous nucleotide substitutions. Mol. Biol. Evol. 3, 418–426 (1986). 3444411
M. Hernán J. Robins Causal Inference: What If (Chapman & Hall/CRC Press 2020).

Публікації, які цитують цю публікацію

Does HIV-1 virulence matter in the ART era?

Eric Lewitus, Morgane Rolland

https://doi.org/10.1016/j.medj.2022.03.003

2022, Med, №4, с.217-219

Scopus

WoS

Цитувань Crossref:0

How to break free: HIV-1 escapes from innovative therapeutic approaches

Gloria Magro, Arianna Calistri, Cristina Parolin

https://doi.org/10.3389/fviro.2022.933418

2022, Frontiers in Virology